影响环氧乙烷消毒作用的主要原因二：

相对湿度的影响:

环氧乙烷需要溶解于水才能向微生物穿透，而它与微生物蛋白质的烷基化反应更是需要适当的水作为介质。因此，当水份低于临界水平(一般认为是相对湿度30%)时，环氧乙烷难以发挥灭菌作用。但是，如果水份太多，势必造成环氧乙烷被稀释和水解，从而减慢其灭菌过程。环氧乙烷的消毒作用与消毒物品的相对湿度是密切相关的。实验表明，用小容器对小物品进行消毒时，以30-50%的相对湿度为宜;对大件物品，则以60-80%的相对湿度为宜。